Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP36Q96G28 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms