Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17Q96FV3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms