Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms