Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL53Q96EL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms