Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPDL1Q96EA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms