Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms