Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms