Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC45Q96CN5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms