Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RUNDC1Q96C34 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms