Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYTL4Q96C24 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL4Q96C24 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms