Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms