Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD2Q969F2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD2Q969F2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms