Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF25Q93038 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms