Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRAT1Q92837 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms