Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXX5

DNAJC9, DnaJ homolog subfamily C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC9Q8WXX5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC9Q8WXX5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC9Q8WXX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms