Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPC1Q8WXF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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