Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf54Q8WWF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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