Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms