Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSKUQ8WUA8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms