Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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