Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA3Q8TBC4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms