Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEST2Q8NFU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms