Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms