Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMG8Q8ND04 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMG8Q8ND04 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms