Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms