Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF557Q8N988 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF557Q8N988 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms