Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF1Q8N6C5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms