Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC2Q8N158 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GPC2Q8N158 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms