Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms