Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLX4Q8IY92 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms