Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM2Q8IXS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2Q8IXS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms