Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms