Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC103Q8IW40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC103Q8IW40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms