Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLD3Q8IV08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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PLD3Q8IV08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLD3Q8IV08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLD3Q8IV08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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