Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB4Q86W47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms