Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD3Q86TU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD3Q86TU7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms