Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R42Q7Z4L9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP1R42Q7Z4L9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R42Q7Z4L9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms