Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3Q7Z3Z2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms