Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG9AQ7Z3C6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG9AQ7Z3C6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms