Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX8Q7RTT4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX8Q7RTT4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms