Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms