Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms