Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms