Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms