Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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