Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELC1Q6UW63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDELC1Q6UW63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELC1Q6UW63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELC1Q6UW63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELC1Q6UW63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms