Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTC3Q6UUV7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms