Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms