Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms