Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC174Q6PII3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC174Q6PII3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms